Přeskočit na obsah

První společná publikace v rámci konsorcia NanoPrecMed: VUT Brno a LBI Trauma publikují studii o biologii G-kvadruplexů

Nový rok začíná pozitivně: v renomovaném časopise Genomics vychází první přímá spolupráce dvou partnerských institucí konsorcia NanoPrecMed. Výzkumníci z Vysokého učení technického v Brně a z LBI Trauma společně zkoumali distribuci a potenciální regulační roli G-kvadruplexů (G4) v genomu Sus scrofa – známého také jako divoké prase.

G-kvadruplexy jsou speciální struktury DNA, které mohou hrát roli v regulaci genů. Chovají se jako malé „záložky“ uprostřed tisíců párů bází naší DNA. Zatímco v lidském genomu jsou intenzivně studovány, o jejich funkci u prasete – což je stále důležitější modelový organismus v translační medicíně – zatím existuje jen málo systematických dat. Předložená studie poskytuje komplexní bioinformatickou analýzu a poukazuje na výrazné shlukování G4 v určitých funkčních oblastech genomu.

Výzkum vznikl v úzké spolupráci mezi VUT Brno a LBI Trauma. Kombinuje in silico analýzy s molekulárně-biologickým kontextem a je výsledkem interdisciplinární expertízy v rámci konsorcia NanoPrecMed. Autoři považují své výsledky za základ pro další studie – například o roli G4 v buněčné komunikaci nebo v kontextu extracelulárních vezikul, což jsou témata přítomná i v rámci konsorcia.

Odkaz na publikaci:
Šislerová L, Petrovič M, Dobrovolná M, Šťastný J, Rozmaric T, Dworak H, Kratochvilová L, Veselá L, Schädl B, Gruber F, Grillari J, Freystätter C, Ogrodnik M, Brázda V. G-quadruplex motifs prediction and visualization in Sus scrofa genome. Genomics. 2025 Dec 6;118(1):111168.